В МАОУСОШ 2 им. Ю. А. Гагарина в соответствии с Уставом функционируют следующие структурные подразделения:
1.Центр «Точки роста»
2. Библиотека
3. Бухгалтерия (платные образовательные услуги, финансово-хозяйственная деятельность)
4.Школьная столовая